許多先天疾病能使小孩得青光眼。這些先天疾病有的遺傳，有的不遺傳，但都會(huì)在出生時(shí)或不久后就表現(xiàn)出來。盡管眼睛的其他部分最初包括在這些病中，但它們最終會(huì)引起青光眼，因?yàn)樗鼈儠?huì)損傷眼睛的引流子流。
        這些情況比原發(fā)性嬰幼兒型青光眼少得多。由于常常有眼睛某些部分的發(fā)育不全，所以難治。如果出現(xiàn)青光眼，則其治療方案和原發(fā)性嬰幼兒型青光眼相同。

家族性虹膜發(fā)育不全

       這種病可遺傳，以眼睛虹膜結(jié)構(gòu)發(fā)育不全為特征發(fā)育不全的虹膜阻住小梁網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)，發(fā)生青光眼。盡管出生時(shí)就存在缺陷，但青光眼可在出生時(shí)或以后任何時(shí)候甚至成年后發(fā)生。但是顯然患這種病的人沒有人能長期逃脫青光眼。這樣的青光眼患兒手術(shù)效果好。如果成年后才發(fā)病，激光或手術(shù)治療可控制眼壓。

無虹膜癥

        無虹膜癥意味著虹膜缺失。這種情況很罕見，胎兒第二十周時(shí)雙眼發(fā)育受到影響，虹膜只留下一小段殘根。殘根前移，粘在房角壁上。妨礙小梁網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)，出現(xiàn)青光眼。角膜也可能受影響。如果它變混濁，還會(huì)發(fā)生白內(nèi)障，大多數(shù)患者視力可到20/200 ，法律上認(rèn)為屬于失明，但仍有少數(shù)人視力可正常。有一類無虹膜癥被認(rèn)為是由于11號(hào)和13號(hào)染色體部分缺失而遺傳的，這種情況與智力發(fā)育遲緩有關(guān)。
        無虹膜癥引起的青光眼難以治療，因?yàn)槿绻委煙o虹膜癥引起的青光眼難以治療，因?yàn)槿绻委煵荒芸刂谱⊙蹓海龠M(jìn)一步采取手術(shù)治療會(huì)很危險(xiǎn)。無虹膜的眼睛極脆弱，手術(shù)會(huì)造成更多的外傷。同樣，白內(nèi)障摘除術(shù)和角膜移植也很危險(xiǎn)。
        患這種病的人通常會(huì)完全失明，但這種病很少見，10萬至100萬兒童中才有1個(gè)因此失明。